Le climat à Safaga est celui du désert. Il y à deux saisons principales - l'été d'Avril à Octobre et l'hiver de Novembre à Mars. Durant l'été, le thermomètre monte jusque 35 degrés pendant la journée et descend à 25 degrés pendant la nuit. L'hiver il fait 20-25 degrés la journée et 15 degrés la nuit.

Il ne pleut quasiment jamais à Safaga, seulement quelques gouttes 1 à 2 fois par an.

Avec des statistiques de vent exceptionnelles, Safaga est l'endroit parfait pour la pratique du kitesurf et de la planche à voile, toute l'année. Grâce à un effet thermique dû au désert et aux montagnes qui environnent la région, le vent est généralement 1 ou 2 beaufort plus fort que à Hurghada. Normalement le vent souffle “side-offshore” le matin (du Nord-Ouest), puis en fin de matinée, il tourne pour s'établir “side shore” (Nord), en se renforçant avec un effet thermique. En fonction des saisons, le vent faiblit lentement l'après-midi mais il peut également souffler jusqu'au coucher du soleil.